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貝克曼庫爾特公司與國家CDC合作開發甲型H1N1流感病毒快速檢測方案
2009-5-26 來源:貝克曼庫爾特公司
關鍵詞:貝克曼庫爾特公司 病毒核酸提取

    世界衛生組織已將甲型H1N1流感警告級別提到5級,強烈顯示即將發生的大流行。據世衛組織公布,截止于2009年5月13日11點,全球確認甲型H1N1流感5,969例并蔓延28個國家,給各國在緊急預警和疫情控制方面提出了嚴峻的挑戰。繼香港首例甲型H1N1確診后,5月11日,四川一例甲型H1N1流感疑似病例被確診,5月12日17時,山東報告1例甲型H1N1型流感疑似病例,當日香港發現一名甲型H1N1流感疑似個案。由于病毒引起的感染癥狀多比較相似,采用常規方法很難確認感染類型,因此對于甲型H1N1流感的早期快速確診對于有效控制疫情至關重要。

  美國貝克曼庫爾特公司在病毒核酸提取,實驗室自動化和病毒核酸檢測領域有著豐富的經驗和完整的解決方案。針對本次甲型H1N1流感疫情,公司已與國家CDC開展合作,根據世界衛生組織最新發布的H1N1流感病毒序列信息和雙方技術基礎聯合開發甲型H1N1型流感病毒快速診斷方案,并同時開發包括人流感,禽流感,豬流感,SARS等多種上呼吸道病毒檢測和變異分析標準方案,該方案具有快速、準確、安全、低成本等特點,并可用于流感病毒快速篩查、病毒分型、突變檢測和流行病學研究。

  • 病毒核酸安全提取
  美國貝克曼庫爾特公司的SPRI-TETM Viral NA提取試劑盒結合SPRI-TETM自動核酸提取儀,為甲型H1N1流感病毒核酸的提取提供了快速安全的解決方案。SPRI-TETM采用固相載體可逆式磁珠對病毒RNA進行高效抽提,從樣品的裂解到核酸的洗脫都無需人工干預,將操作者危險性降到最低。SPRI-TETM系統可以一批次提取1-10個樣品,每批次提取時間約30分鐘。

  • 特異性引物設計
  根據WHO已公布甲型H1N1流感序列,美國貝克曼庫爾特公司與國家CDC合作設計出高特異性PCR擴增引物組。該引物組采用GeXP系統的 eXpress ProfilerTM模塊設計,包括5對特異性引物,分別為A型流感,H1N1型流感,季節性流感,甲型H1N1流感和質控序列。與常規PCR引物不同,每對引物5’端均帶有通用引物,5組擴增產物長度范圍在100- 600堿基。

  • 甲型H1N1病毒快速檢測
  利用貝克曼公司專利的XP-PCR技術,對5對引物(5對流感病毒特異引物和一對內質控引物)進行多重擴增( 整個流程由BiomekTM系列自動化工作站完成)。多重PCR產物因長度不同,可經過毛細管電泳分離檢測。電泳原始數據、樣本信息和基因信息輸入GeXP軟件系統進行分析, 即可得到樣本的病毒檢測報告。

  • 病毒分型和變異檢測
  在多重病毒監測基礎上,利用標準甲型H1N1病毒引物擴增病毒基因組序列,利用GeXP系統的序列分析功能分析病毒變異位點和可能的蛋白質序列變異。
  該方法可以將常見流感癥狀的可能病原體一次性掃描,確定檢測樣本的感染類型,具有樣本需求低,檢測速度塊,同時可以監測病毒的變異狀況。

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(子妍)
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