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血清蛋白-兒茶素復(fù)合物的計(jì)算機(jī)模擬研究

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關(guān)鍵詞：

：Replica Exchange Monte Carlo(REMC) 兒茶素血清蛋白輸水相互作用
復(fù)合物

資料大小：

119K

所屬學(xué)科：

分子表征

來(lái)源：

2013年全國(guó)高分子學(xué)術(shù)論文報(bào)告會(huì)（2013.10.12~16，上海）

簡(jiǎn)介：

兒茶素具有多種健康促進(jìn)作用,研究其與蛋白的相互作用對(duì)于解答相關(guān)生物活性和功能材料開(kāi)發(fā)具有重要意義。盡管實(shí)驗(yàn)上已有若干兒茶素與蛋白復(fù)合物的研究，然而卻沒(méi)有利用計(jì)算機(jī)模擬揭示該類(lèi)復(fù)合物形成機(jī)制和分子相互作用分子等細(xì)節(jié)的報(bào)道。基于兒茶素與蛋白相互作用的特點(diǎn)，我們引入了具有方向依賴(lài)性的輸水相互作用，用以描述芳環(huán)之間的π堆砌作用。利用REMC模擬，我們考察了兒茶素與血清蛋白的摩爾比和體系的離子強(qiáng)度對(duì)復(fù)合物的影響，并對(duì)多個(gè)基于實(shí)驗(yàn)的推測(cè)進(jìn)行了論證。我們發(fā)現(xiàn)：僅有少量的兒茶素充當(dāng)橋聯(lián)作用以形成較大的復(fù)合物；增加兒茶素一方面會(huì)降低蛋白結(jié)合部位的特異選擇性，另一方面會(huì)抑制蛋白的自聚集行為；血清蛋白與兒茶素的強(qiáng)結(jié)合在約4.6個(gè)兒茶素時(shí)達(dá)到飽和，遠(yuǎn)低于實(shí)驗(yàn)報(bào)道值。該方法對(duì)于在規(guī)模和細(xì)節(jié)平衡上研究其它蛋白復(fù)合物體系具有重要的參考價(jià)值。

作者：

李云琦，安立佳，Qingrong Huang

上傳時(shí)間：

2013-11-11 16:38:10

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