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DNA 雜交機理的粗粒化分子模擬研究  
DNA 雜交機理的粗粒化分子模擬研究
資料類型: JPG圖片格式
關鍵詞: DNA  雜交  分子模擬  拉鏈模型  
資料大小: 96K
所屬學科:
來源: 來源網絡
簡介:
DNA雜交機理是生物學領域一個廣受關注的基礎性問題,其成核細節尚不為人所知。Ouldridge等最近開發了一個新的粗粒化DNA模型—oxDNA,合理的擬合了DNA的氫鍵相互作用和堆疊相互作用,能夠同時表現DNA單鏈的柔性和雙鏈的剛性。到目前為止,該模型已經成功的應用于一系列的DNA結構以及DNA納米器件的模擬,如DNA鑷子和DNA行走機器人。我們以該模型為基礎,通過引入贗動力學(metadynamics)和過渡路徑采樣(transitionpathsampling)方法,研究了短鏈DNA的雜交機理和成核機理。研究結果表明,只有單一重復序列才采用“滑行式(slithering)”的雜交方式,不遵循特定的路徑;而對于一般隨機序列,其采用“拉鏈式(zippering)”的雜交方式,有較為嚴格的形成路徑。
上傳人: liu
上傳時間: 2013-11-14 16:41:36
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