教育部及上海市有關部門領導、部分高校黨政負責人等出席儀式
國家教育部、上海市政府《關于上海交通大學與上海第二醫科大學合并的原則意見》以及《關于繼續重點共建復旦大學、上海交通大學、同濟大學的協議》簽約儀式，6月10日上午在人民大廈舉行。中共中央政治局委員、上海市委書記陳良宇出席儀式表示祝賀。
教育部部長周濟，上海市委副書記、市長韓正分別代表教育部和上海市政府簽署有關協議。教育部副部長吳啟迪、上海市委副書記殷一璀、上海市政協副主席王生洪等出席儀式。上海市副市長嚴雋琪主持儀式。
周濟在講話中指出，上海市委、市政府一貫高度重視、大力支持教育事業發展，高度重視教育資源的合并重組和優化配置，有力推動了高校學科和隊伍建設，提高了人才培養、科學研究和社會服務水平，在全國起到了重要的表率和示范作用。兩個協議的簽署，標志著上海高教事業進入了一個新階段。新組建的上海交通大學可以充分發揮交大多學科的綜合優勢和二醫大在醫學領域的雄厚實力，實現學科互補、資源共享，形成強大綜合競爭力，促使學校逐步發展成為一所學科結構更加合理、綜合實力更強、辦學水平更高、更能適應21世紀高素質創新人才培養和科技發展趨勢的新型大學。他表示，教育部將一如既往支持上海教育事業的全面建設和發展，以使上海早日實現在全國率先進入教育現代化城市的發展目標。
韓正在講話中指出，兩個協議的簽署是進一步貫徹國家高校發展戰略和推進上海科教興市主戰略的重要舉措，也是深化上海教育綜合改革試驗的實踐探索。教育部與上海市政府按照中央"集中資源，突出重點，體現特色，發揮優勢，堅持跨越式發展，走有中國特色的建設一流大學之路"的要求，以強強聯手、追求雙贏為目標，通過部市合作共同努力，促成了上海交大和上海二醫大的合并，探索了一種新的合作模式，符合高等教育辦學規律，也有利于調動學校和學院兩方面的積極性。對交大來說，可以進一步拓展學科建設和平臺建設，提升在國內外的知名度，真正建成世界一流綜合性大學；對二醫大來說，可以借助交大品牌，實現資源共享，推進一流醫學學科和一流醫學人才的培養。
教育部和上海市政府重點支持復旦大學、上海交通大學、同濟大學的"985工程"一期建設已開展了卓有成效的工作，隨著第二期協議的簽署，將進一步深入推進部市合作共建這三所高校的進程。
根據協議，在“985工程”二期建設中，教育部、上海市將繼續重點共建這三所高校，并以原則上不低于“985工程”一期的投入數繼續給予專項經費投入。
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