科學(xué)家繪制出橡膠樹(shù)基因組草圖 有助提高天然橡膠產(chǎn)量
2016-06-28 來(lái)源：中國(guó)聚合物網(wǎng)
日本和馬來(lái)西亞研究人員合作成功繪制出精度達(dá)93.7％的橡膠樹(shù)基因組草圖，這將有助于培育更加高產(chǎn)的橡膠樹(shù)，提高天然橡膠的產(chǎn)量。
日本理化學(xué)研究所日前發(fā)布一份公報(bào)說(shuō)，該研究所和馬來(lái)西亞理科大學(xué)的研究人員對(duì)東南亞廣泛栽種的橡膠樹(shù)品種“PRIM600”進(jìn)行了基因組測(cè)序。他們首先利用約100個(gè)堿基短序列信息以99％以上精度進(jìn)行解讀的“Illumina”方法，與7000個(gè)堿基長(zhǎng)序列信息以85％精度解讀的“PacBio”方法組合，解讀出高于預(yù)想基因155倍的信息量，獲得了1.55Gb的橡膠樹(shù)基因組草圖。然后，對(duì)獲得的基因組草圖進(jìn)行了基因組注釋?zhuān)A(yù)測(cè)出約84000個(gè)遺傳基因，包含全部93.7％以上的遺傳基因信息。研究小組利用“CAGE法”對(duì)帕拉橡膠樹(shù)的葉、莖和膠乳進(jìn)行RNA檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)了全遺傳基因的基因表達(dá)量和轉(zhuǎn)錄起始部位。結(jié)果顯示，與葉、莖相比，膠乳的天然橡膠相關(guān)基因高出100倍以上。
膠乳是脂質(zhì)和蛋白質(zhì)組成的稱(chēng)為“橡膠粒子”的乳白色小分子懸浮液。研究發(fā)現(xiàn)，橡膠粒子的蛋白質(zhì)基因在染色體組上，形成了在轉(zhuǎn)錄的相同方向排列的基因簇。在獲得帕拉橡膠樹(shù)遺傳基因信息的基礎(chǔ)上，研究小組對(duì)各種橡膠樹(shù)育種系統(tǒng)重新測(cè)序，得到了品種間差異的詳細(xì)信息。
雖然橡膠樹(shù)的原產(chǎn)地在巴西亞馬孫熱帶雨林，但目前90%產(chǎn)出天然橡膠的橡膠樹(shù)都栽種在東南亞地區(qū)。全球經(jīng)濟(jì)發(fā)展對(duì)天然橡膠的需求日趨增長(zhǎng)，解讀橡膠樹(shù)的基因信息將有助于更科學(xué)高效地種植橡膠樹(shù)，獲取品質(zhì)更高的天然橡膠。
要想完成全基因組測(cè)序通常需要花費(fèi)大量的時(shí)間和人力，因此很多時(shí)候都是繪制基因組草圖。這一研究成果已經(jīng)發(fā)表在英國(guó)《自然》雜志子刊《科學(xué)報(bào)告》上。
原文鏈接：The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis
膠乳是脂質(zhì)和蛋白質(zhì)組成的稱(chēng)為“橡膠粒子”的乳白色小分子懸浮液。研究發(fā)現(xiàn)，橡膠粒子的蛋白質(zhì)基因在染色體組上，形成了在轉(zhuǎn)錄的相同方向排列的基因簇。在獲得帕拉橡膠樹(shù)遺傳基因信息的基礎(chǔ)上，研究小組對(duì)各種橡膠樹(shù)育種系統(tǒng)重新測(cè)序，得到了品種間差異的詳細(xì)信息。
雖然橡膠樹(shù)的原產(chǎn)地在巴西亞馬孫熱帶雨林，但目前90%產(chǎn)出天然橡膠的橡膠樹(shù)都栽種在東南亞地區(qū)。全球經(jīng)濟(jì)發(fā)展對(duì)天然橡膠的需求日趨增長(zhǎng)，解讀橡膠樹(shù)的基因信息將有助于更科學(xué)高效地種植橡膠樹(shù)，獲取品質(zhì)更高的天然橡膠。
要想完成全基因組測(cè)序通常需要花費(fèi)大量的時(shí)間和人力，因此很多時(shí)候都是繪制基因組草圖。這一研究成果已經(jīng)發(fā)表在英國(guó)《自然》雜志子刊《科學(xué)報(bào)告》上。
原文鏈接：The rubber tree genome shows expansion of gene family associated with rubber biosynthesis
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